Recruté en tout début d’année 2016 par l’Atlético-MG, le milieu de terrain offensif, Carlos Eduardo ne sera pas parvenu à se faire sa place au sein de l’effectif mineiro depuis son arrivée avec seulement dix matchs de Brasileirão dont quatre comme titulaire. Grand espoir du football brésilien lors de ses débuts à Grêmio, il a connu une grave blessure au genou lors de son passage à Hoffenheim mettant un frein à sa progression et ne s’est jamais vraiment relevé avec deux passages au Rubin Kazan et une aventure rapide à Flamengo.
Voulant se relancer avec le Galo, sa mission a été un échec et devrait le pousser un peu plus vers la sortie, lui qui a reçu une offre du club turc de Karabukspor, d’après son agent, Jorge Machado. Agé de 29 ans, il ne sera pas retenu par l’Atlético-MG qui se séparera d’un gros salaire et qui ne fait pas partie des plans de Roger Machado pour 2017.